우리 주변에는 다양한 미생물이 서식하고 있습니다.
자연계에 서식하는 모든 미생물을 인공적으로 분석하는 데는 한계가 있지만, 우리 생활에 이용되는 미생물은 배양 가능한 균이라 생각하면 됩니다.
토양미생물은 문헌상에 주로 세균, 방선균, 진균, 조류 등으로 분류되고 있지만 방선균은 세포의 구조적 특성상 분류학적으로 세균에 포함되어 있음을 기억할 필요가 있습니다.
진균은 곰팡이, 효모, 버섯 등을 아우르는 미생물입니다. 여기서는 세균과 진균 가운데 농업과 관계가 깊은 미생물에 대해 살펴보고자 합니다.
3-2-4 미생물의 주요 종류
3-2-4-1 세균
세균분류에는 버지편람 Bergey's manual이 많이 이용된다.
버지편람은 1권 아케아고세균 Archaea,
2권 프로테오박테리아변형균 Proteobacteria,
3권 피르미쿠테스 Firmicutes(후벽균),
4권 스피로헤테스 Spirochaetes(나선균), 그리고
5권 악티노박테리아 Actinobacteria(방선균)로 구성되어 있다.
농산업으로 이용되는 세균은 주로 2권, 3권 및 5권에 수록되어 있어 이에 대해 간략히 살펴보고자 한다.
3-2-4-1-1 프로테오박테리아
프로테오박테리아 Proteobacteria는 변형균문으로 알파, 베타, 감마, 델타, 엡실론, 제타 등 6개의 변형균강 class이 있지만 농업과 관련된 주요 세균은 표3과 같이 알파, 베타 그리고 감마 변형균강에 주로 속한다. 여기서는 분류학상이 아닌 세균의 특성을 고려하여 살펴보고자 한다.
① 질소고정 및 질화세균류
로도스피릴룸 Rhodospirillum은 광합성세균<그림>에 속하며 질소를 고정하기도 한다. 리조비움 Rhizobium은 콩과식물의 뿌리혹세포와 공생관계를 맺어 질소를 고정해주는 박테로이드로 살아간다. 반면에 아조토박터 Azotobacter는 토양에서 독립생활을 하는 균으로 공기 중에 있는 질소를 고정하여 살아간다. 질화세균인 니트로박터 Nitrobacter는 아질산염을 산화하여 질산염을 만들며 니트로소모나스 Nitrosomonas는 암모니아를 산화하여 아질산염을 만든다. 이들 질화세균은 생태적으로 중요하며 토양, 담수, 해수 등에 널리 분포하고 있다.
② 황세균류
티오바실러스 Thiobacillus는 황화수소, 티오황산염, 황원소 등 다양한 무기황화합물을 황산염으로 산화하면서 산소가 없는 상태에서 생육한다. 티오바실러스는 무색황세균이다. 홍색황세균인 크로마티움 Chromatium은 착색균목 chromatiales(착색목균)으로 절대혐기성균이며 황화물과 같은 물질을 이용하는 광무기영양생물로서 광합성을 하며 호수나 습지에 서식한다.
③ 슈도모나스류
슈도모나스 Pseudomonas는 매우 다양한 유기분자를 분해할 수 있다. 슈도모나스속에는 동물과 식물의 병원성 감염체도 있지만, 슈도모나스 플루오레슨스 Pseudomonas fluorescence와 같은 균은 작물의 생육을 촉진하는 미생물로 알려지고 있다. 버콜데리아 Burkholderia는 호기성이고 발효를 하지 않으며 포자를 형성하지 않는 중온성균이다.
④ 장내세균류
에세리키아 Eschericia, 클렙시엘라 Klebsiella, 프로테우스 Proteus, 살모넬라 Salmonella 및 쉬겔라 Shigella는 장내세균이라고도 불린다. 특히 대장균[그림]인 에세리키아 콜리 Eschericia coli는 사람이나 다른 온혈동물의 대장에 서식하므로 분변에 의한 오염도를 측정하는데 지표미생물로 사용된다. 살모넬라는 장티푸스와 위장염을 일으키고, 쉬겔라는 세균성이질, 클렙시엘라는 폐렴을 일으키는 병원체로서 조심해서 취급해야할 세균이다.
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