다음에 나오는 분류표는 독자의 관심이 있는(혹은 농업용으로 사용되는) 미생물이 어디에 속하는구나 하는 정도로 활용하면 되겠습니다.
동물, 식물, 곰팡이 등 우리에게 익숙한 생물은 진핵생물역에 속합니다.
3-2-3-1의 분류표의 주요 속 genus 란에 일반적으로 널리 다루는 미생물을 표기하였으니 참고하시기 바랍니다.
3-2-3 미생물 분류
미생물을 분류하고 동정하기 위해서는 많은 특성이 조사되고 비교되어야 한다. 이들 특성에는 형태적 특성과 생리적 특성이 있다. 형태적 특성에는 세포형태, 세포크기, 집락형태, 미세구조의 특징, 염색성, 섬모와 편모, 운동방법, 포자유무 및 형태와 크기 등이 있다. 한편 생리적 특성에는 탄소와 질소원, 세포벽 구성성분, 에너지원, 발효산물, 영양형태, 적정생육온도, 산소 요구성, 대사산물 등이 있다. 미생물 분류동정에 사용되는 생리적 특성은 대사적 특성과 관련되어 있기 때문에 이들 특성은 곧 미생물을 이용하는 목적에 해당되는 것이라 할 수 있다. 이와 더불어 유전적rRNA 특징의 유사성과 차이를 이용하기도 한다.
미생물학자들은 세 종류의 역 domain으로 구성된 고세균역 Archaea 세균역 Bacteria, 및 진핵생물역 Eucarya 등 분류 체계를 선호하고 있지만<그림>, 분류학자들 간에 3역 분류에 대한 비판이 제기되기도 한다.
진핵생물역에는 동물 Animalia, 식물 Plantae, 진균 Fungi, 원생동물 Protozoa, 크로미스타 색조계(色藻界) Chromista 등이 속해 있고, 고세균역에는 메탄세균 methane bacteria 및 호염성균 등과 같은 특수한 지역에 서식하는 미생물이, 세균역에는 우리가 알고 있는 일반적인 세균이 속해있다.
미생물은 보통 세균, 방선균, 사상균 등으로 구분하는데 계통수 phylogenetic tree에 의하면 세균과 방선균은 세균역, 곰팡이 및 버섯 등의 진균은 진핵생물역에 속함을 알 수 있다. 농산업용으로 사용되고 있는 대부분의 미생물은 세균 및 진핵생물역에 속한다고 이해하면 되겠다.
3-2-3-1 고세균역 분류
문 | 주요 속 | ||
한국어 | 영어 | ||
고세균 | 크렌고세균문 | Crenarchaeota | Sulfolobus |
유리고세균문 | Euryarchaeota | Methanobacterium Halobacterium |
|
코르고세균문 | Korarchaeota | ||
나노고세균문 | Nanoarchaeota | Nanoarchaeum | |
타움고세균문 | Thaumarchaeota | Cenarchaeum, Nitrososphaera |
3-2-3-2 세균역 분류
구분 | 문 | 주요 속 | |||
한국어 | 영어 | ||||
그람양성균(외막없음) | 방선균문 (고G+C) |
Actinobacteria | Streptomyces | ||
후벽균문 (저G+C) |
Firmicutes | Bacillus Listeria Lactobacillus Leuconostoc Acetobacterium Clostridium |
|||
테네리쿠테스문 (세포벽 없음) |
Tenericutes | Mycoplasma Ureaplasma Phytoplasma |
|||
그람음성균(외막있음) | 산수균문 | Aquificae | Aquifex Desulfurobacterium |
||
이상구균-서열균문 | Deinococcus-Thermus | Deinococcus Deinobacterium Thermus |
|||
의간균문/섬유균문-녹균문(FCB군) | Bacteroidetes/Fibrobacteres–Chlorobi(FCB group) | Actibacter Capnocytophaga Fibrobacter Chlorobium |
|||
푸소박테리움균문 | Fusobacteria | Fusobacterium | |||
겜마티모나스균문 | Gemmatimonadetes | Gemmatimonas | |||
니트로스피라균문 | Nitrospirae | Nitrospira | |||
부유균문-우미균문/ 클라미디아균문 (PVC군) | Planctomycetes–Verrucomicrobia/ Chlamydiae |
Chlamydia Chlamydophila |
|||
프로테오박테리아문 | 알파 프로테오박테리아강 | Proteobacteria |
Alphaproteobacteria | Agrobacterium Rhizobium Rhodobacter Rhodospirillum |
|
베타 프로테오박테리아강 | Betaproteobacteria | Burkholderia Thiobacillus Methylobacillus Chromobacterium Neisseria Nitrosomonas |
|||
감마 프로테오박테리아강 | Gammaproteobacteria | Acidithiobacillus Thermithiobacillus Chromatium Thiorhodococcus Methylomonas Azotobacter Pseudomonas Rhizobacter Xanthomonas |
|||
델타 프로테오박테리아강 | Deltaproteobacteria | Desulfobacter Desulfovibrio Geobacter Myxococcus |
|||
입실론 프로테오박테리아강 | (Epsilonproteobacteria | Campylobacter Helicobacter |
|||
제타 프로테오박테리아강 | Zetaproteobacteria | Mariprofundus | |||
스피로헤타문 | Spirochaetes | Borrelia Spirochaeta |
|||
시네르기스테스균문 | Synergistetes | Synergistes | |||
분류미상 | 아키도박테리움균문 | Acidobacteria | Acidobacterium | ||
녹만균문 | Chloroflexi | Chloroflexus | |||
크리시오게네스균문 | Chrysiogenetes | Chrysiogenes | |||
남세균문 | Cyanobacteria | Microcystis Anabaena Nostoc |
|||
탈철간균문 | Deferribacteres | Deferribacter | |||
딕티오글로무스균문 | Dictyoglomi | Dictyoglomus | |||
열탈유간균문 | Thermodesulfobacteria | Thermodesulfobacterium | |||
열포균문 | Thermotogae | Thermotoga |
3-2-3-3 진핵생물역의 진균 분류
계 | 아계 | 문(아문) | 주요속 | |||
한국어 | 영어 | |||||
균계 Fungi |
- | 블라스토클라디아균문 | Blastocladiomycota | Allomgyces | ||
호상균문 | Chytridiomycota | Rhizophydium | ||||
취균(聚菌)문 | Glomeromycota[1] | Glomus | ||||
미포자충문 | Microsporidia | Caudospora | ||||
네오칼리마스트릭스균문 | Neocallimastigomycota | Neocallimastix | ||||
쌍핵균아계 Dikarya |
불완전균문 포함 | inc. Deuteromycota | ||||
자낭균문 | Ascomycota | Aspergillus Penicillium |
||||
주발버섯아문 | Pezizomycotina | |||||
사카로미케스아문 | Saccharomycotina | Saccharomyces | ||||
외자낭아문 | Taphrinomycotina | Taphrina | ||||
담자균문 | Basidiomycota | |||||
담자균아문 | Agaricomycotina | 버섯류 | ||||
녹균아문 | Pucciniomycotina | |||||
깜부기균아문 | Ustilaginomycotina | |||||
- | 접합균문 | Zygomycota | ||||
곤충곰팡이아문 | Entomophthoromycotina | |||||
키크셀라아문 | Kickxellomycotina | |||||
털곰팡이아문 | Mucoromycotina | Absidia Mucor Rhizomucor Rhizopus |
||||
포충균아문 | Zoopagomycotina |
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